采用生物信息学和实验方法联合分析转录组信息
High-throughput protein analysis integrating bioinformatics and experimental assays. Nucleic Acids Res. 2004 Feb 3;32(2):742-8 The wealth of transcript information that has been made publicly available in recent years requires the developme
转录因子研究——为论文加“分”
什么是转录因子？ ● 转录因子（Transcription factor，TF）是一类能与特异性DNA序列结合并调节基因转录的调控蛋白。 ● 转录因子通常是细胞内信号通路的核心蛋白，是将外界刺激转化为
RNA凝胶电泳试验
实验基本原理 RNA可以使用非变性或变性凝胶电泳进行检测。在非变性电泳中，可以分离混合物中不同分子量的RNA分子，凡是无法确定分子量。只有在变性情况下，RNA分子完全伸展，其泳
总RNA 的非变性电泳检测
总 RNA 的电泳检测，原来我使用 Lambda DNA/EcoR I （或者 Hind III）酶切 Marker，现在基本上不再用 Marker 了。指示剂一定是溴酚蓝加二甲苯氰，胶浓度 1-1.2%。加样后，开始电泳 (电压的选择的
RNA酶活性的控制
为了获得高质量的真核细胞mRNA， 必须使用RNA酶的抑制剂或采用下述的破碎细胞和灭活RNA酶同步进行的方法，最大限度地降低细胞破碎过程中所释放的RNA酶的活性。同时，避免偶然引入
RNA操作中的一般要求
在所有RNA实验中，最关键的因素是分离得到全长的RNA。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶（RNA酶）的污染。由于RNA酶广泛存在而稳定，一般反应不需要辅助因子。因而RNA制剂中只要存
RNA酶保护试验（RPA）
一、RNA酶保护试验（RPA） RNA酶保护试验（（RNase Protection Assay，RPA）即糖核酸酶保护实验（Ribonuclease protection assay，RPA）是近十年发展起来的一种全新的mRNA定量分析方法。本文主要介绍
S1核酸酶保护实验
一、材料准备 4μL5X T4激酶缓冲液 5 μl [γ-32P] ATP（7000次/毫摩尔） 10 μl 水+寡核苷酸（200毫微克） 1μlT4激酶 1. 37摄氏度1小时 2. 热失活，在75℃下10分钟。 3. 加入1μl糖原（20毫克/毫升），
DNA SMART技术让ChIPSeq研究更轻松
Clontech是cDNA合成技术的引领者，近年来SMART(Switching Mechanism at 5’ End of RNATemplate)技术被公认为是微量RNA和单细胞RNA-seq的行业金标准。现在创新的DNASMART技术将模板转换机制的优势拓展到了
核糖核酸酶保护测定（二）
1. 加入适当体积的RNA（12 μl）+探头（3 μl）。 尝试5和10μg 的RNA加600或800页高辛标记的探针。 2. 包括2-3的酵母RNA样品/探针使用。 3. 加入20 μl SOLN。 A到所有涡管（FV =30 μl）和自旋向下。
