TRIzol法提取DNA、RNA、蛋白质时常见问题
TRIzol法提取DNA、RNA、蛋白质时我们常会遇到以下问题
一、DNA的分离常见问题
得率低:
A.样品匀浆和裂解的不彻底。
B.最终得到的DNA沉淀没有完全溶解。
A260/A280<1.70 :
A. 检测吸光度时,RNA样品没有溶于水,而溶于了TE中。
B.酚除去的不彻底,可用0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)再洗一遍DNA沉淀。
DNA降解:
A.组织取出后没有马上处理或冷冻。
B.待提取RNA的样品没有保存于-60至-70℃,而保存在了-5至-20℃。
C.样品匀浆时使用了高速匀浆仪。
RNA污染:
A.氯仿分层后水相去除的不干净。
B.DNA沉淀用0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)洗的不彻底。
二、RNA的提取常见问题
得率低:
A.样品裂解或匀浆处理不彻底。
B.RNA沉淀未完全溶解。
A260/A280<1.65 :
A.检测吸光度时,RNA样品没有溶于水,而溶于了TE中。低离子浓度和低pH值条件下A280值偏高。
B.样品匀浆时加的试剂量太少。
C.匀浆样品时未在室温放置5分钟。
D.吸取水相时混入了有机相。
E.RNA沉淀未完全溶解。
RNA降解:
A.组织取出后没有马上处理或冷冻。
B.待提取RNA的样品没有保存于-60至-70℃,而保存在了-5至-20℃。
C.细胞在用胰酶处理时过度。
D.溶液或离心管未经RNase去除处理。
E.电泳时使用的甲醛pH值低于了3.5 。
DNA污染:
A. 样品匀浆时加的试剂量太少。
B.样品中含有有机溶剂(如乙醇,DMSO等),强缓冲液或碱性溶液。
蛋白聚糖和多糖污染:
沉淀RNA的过程中作以下改进可去除这些污染,步骤7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8M柠檬酸钠和1.2MNaCl)混合离心,按之前操作进行。这种方法可使蛋白聚糖和多糖留在溶液中,高效沉淀出纯RNA。从含有大量多糖的植物中提取RNA时应在匀浆后离心,并加上以上操作步骤。
三、蛋白质的提取
常见问题分析:
得率低:
A.样品裂解或匀浆处理不彻底。
B.最后得到的蛋白质沉淀未完全溶解。
蛋白质降解:组织取出后没有马上处理或冷冻。
电泳时条带变形:蛋白质沉淀洗涤不充分。
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